cancer lncRNA gene database (PCdb) Home
PCdb
cancer lncRNA database
General information | Expression | lncRNA | Regulation | Mutation | Homolog | Interaction

Basic Information

Gene ID

2957

Name

GTF2A1

Synonym

TF2A1|TFIIA|TFIIA-42|TFIIAL;general transcription factor IIA, 1, 19/37kDa;GTF2A1;general transcription factor IIA, 1, 19/37kDa

Definition

TFIIA alpha, p55|general transcription factor IIA subunit 1|glucose regulated protein, 58kD pseudogene|transcription initiation factor IIA subunit 1|transcription initiation factor TFIIA 42 kDa subunit

Position

14q31.1

Gene Type

protein-coding

Pathways and Diseases

Pathway

carm1 and regulation of the estrogen receptor;PID BioCarta;100219

Pathway

General transcription regulation;PANTHER;P00023

Pathway

Basal transcription factors;KEGG PATHWAY;hsa03022

Pathway

Transcription;Reactome;REACT:1788

Pathway

HIV Infection;Reactome;REACT:6185

Pathway

Transcription regulation by bZIP transcription factor;PANTHER;P00055

Pathway

Gene Expression;Reactome;REACT:71

Disease

CANCER;GAD

Disease

stomach cancer;GAD

External Links

Links to Entrez Gene

2957

Links to all GeneRIF Items

2957

Links to iHOP

2957

Sequence Information

Nucleotide Sequence

>2957 : length: 6403
GGCGGCGGCGGCGGCGGCGGTGGTGGCTCGCGCAGCTTGTTGGCTCGCTATATAAAGGAG
AGAAGCGGGCGGACCGGACGGCTGGAGCTGCAGCCGGTGGCGGCAGCGGCGGCGCAGGGA
GCGGTGACCGGTGGTGGTTTCCCTCCTTGGCGCGGGGTGGGGAGCGGGCAACGCCCCCCG
GACCCCTGAAGGGTCGTGGCTTTTTTTTTTTTTTTAAGGCGATTCTCGAGGTTTTCAGCT
GCGGGAGGAGTGCCCCCCTCCTCCTCCTCTCTCCGCTCTCCCCTACTCCTTCAGGATTGA
TTTTGTTTAAAATTTTTTCCCCAATCTTGCGGTGATTTGGGTCACCCTCCGGGTGTTATA
GTTTTTTTTTTTTTGGTTTTGTTTTTATCTTGTTTTCTTGGGGTTGCCCCCTCTTGTTTG
TGTTGTGTGTGGAAATGGCGAACTCGGCAAATACAAACACCGTGCCTAAATTATACAGAT
CTGTGATTGAAGATGTCATTAATGATGTGAGAGACATCTTTCTGGATGATGGAGTGGATG
AACAAGTACTGATGGAACTAAAAACTATCCTGAATAAGACAGTTGCTGCCCAGAAGATGT
TCATACTTTGGTAGAAATGGTAGACTTTGTGTGTTATGGGAAAACAAACTAATGCAGTCC
AGGGCAGTAGATGGATTTCATTCAGAAGAGCAGCAGCTTCTACTGCAAGTTCAACAGCAG
CATCAACCCCAGCAGCAGCAGCATCACCACCATCACCATCATCAGCAAGCTCAGCCTCAG
CAGACAGTACCTCAGCAAGCGCAGACCCAGCAGGTTCTTATTCCTGCATCACAGCAAGCC
ACAGCACCACAAGTTATTGTTCCAGATTCTAAGTTGATACAGCATATGAATGCATCAAAC
ATGAGTGCTGCTGCTACAGCTGCTACCTTAGCACTCCCTGCAGGTGTGACTCCTGTTCAG
CAGATATTAACAAATTCAGGCCAGCTTCTTCAGGTGGTCAGAGCAGCCAATGGTGCCCAA
TATATCTTTCAGCCTCAGCAGTCAGTGGTTCTACAACAACAGGTTATACCACAAATGCAG
CCTGGTGGAGTACAAGCTCCTGTTATACAGCAGGTGCTGGCTCCTCTTCCTGGAGGGATT
TCACCACAGACAGGTGTCATCATCCAGCCTCAGCAAATCTTATTTACAGGAAATAAGACT
CAAGTTATACCTACGACAGTGGCAGCACCTACACCAGCCCAAGCACAGATAACTGCAACT
GGCCAGCAGCAACCGCAGGCCCAGCCTGCTCAAACACAAGCTCCATTGGTCTTACAAGTT
GATGGAACTGGGGATACATCATCTGAAGAAGATGAAGATGAAGAAGAAGACTATGATGAT
GATGAGGAGGAAGACAAAGAGAAAGATGGAGCTGAAGATGGGCAGGTGGAAGAAGAGCCC
CTCAATAGTGAAGATGATGTGAGTGATGAGGAAGGACAGGAACTCTTTGACACAGAAAAT
GTTGTTGTATGCCAATATGATAAGATACACAGAAGTAAAAACAAATGGAAATTTCATCTC
AAGGATGGCATTATGAATCTTAATGGAAGAGATTATATATTTTCCAAAGCCATTGGAGAT
GCAGAATGGTGAAGAGTTGCTTTTTTTCTTTTATAAATAAAAGAAACTTAAAAAAAATGT
AAAGCGGACAGTTTGAAACTTGGGGCATATGCCAACCAAAACTTCGTTTCTGCATGTCAG
AAAAGTGCAGTAGAAGCAAAGCTACTGGAACAAAGATAGACCTTGACAACATAGACACTA
CTTACTGGCAAGCCATGGAACTGTAGCACCTAGGGTTTTTGGGTGGGAGGGTTGGGGTTT
TGTGTAGGAAAACCATAATTGTTGATTTTAAATACAGGTACCTGCCACCGGTAATTAGCA
TGTAAAGCTTTGTCTATATTCCTTCCTCCAACTTGGGTTCAATCAGAAGATACTTGTTGG
AATGAACTGAAGAAACTTCCCTTTTGATAGATTGAACTGAAACTGCTTATTGTATGTGGT
TATATTTGGTAAAAGTTGCGTGTGAGCTTTTTACAAAAGGGTAAGAATTGTGTTGAATTT
TAATTCACTTGTATAAGAAAACAATTTAAAACTCTCATAATAGGTCTTAAATATTTTTAC
TTGCTATTCTCCCTCAGTGATATATACCTCTTCCTTTCCAGCTTTATGAAACATCTATTT
AAGATTTAAAGTTATCAGTGATCATAGTTTGGAGATAAAATTTGACCCAGGAATGAATAT
TTATTTTAATTAGGTTTTCATACTTATTAAATGTAATTAAAGACTTGGGTCTTGTCTGAG
TTCAGTGGAATTGAAACCACAACTTTAATTTCCTTACAGAAAAACTTAATTTGTTTCTTT
TAGTGCCACACCTTAAAAAGAAACCCCAAACTAGCTCCTCAGGAATATAGTTTTATTTTG
CAAGCATACCATCTAGCTGAAATTGTATACACATGAATATATGTAGACTTTTCCTGTTGG
GCTGAAGTGTGTGCTTATAAATGTGTTTAGTTTTTAAGCTAAACATTCAGTTAACAGTCT
GTGCATTGATTAGCATAGGGCAGGTGGTGAGGACCTGGATTTTTATTAAACAGTTTAGTA
ATTATAAAAGTTTCTTGTGTTTACTAGTAAAGAATTTTAAAAATCTATTCTAATTCAACA
AGTTTTTAAAATCAACTTTGTAATTTGAGGGGAAAATTTGGGGGGAAGAGGTGGGTGGGC
CACTAAGTTACCTCTCTTTCATTTGGTGGCCCTTCCAGGCCATTGAAAATAAAGACGTTG
GCTCCAGTTTGCACATTGGGAAGAAAGCATAGAAATTTGACTTGTATATTAAAAATAATA
GAAATGTAATATGTATATTAAGAATGCATAGGTCTGTATTCTGTAAGGGGCTCTGAAGAA
CAATATGGCACTGCTGTGTTCAGTGTGAATTCACTGCCTGGGAGAACTGCAGGAATGCTT
GTCTTCACCATTGTGTTCTTACAACGAATTCAACTTTCCATGGTTTATCTTGACAAAATT
TACATGTGTTTAGGTTACTTGTATATTGATATATTTTTTTAATCTTCAGTTTTTGTCTTC
CTTTTGCCTTTGTGTTTTCAGAAGTAACACATGAACACTTTTTAAAGTACATTACAGAGA
AGAAAACTGTGAGCTATTATATAGTGTTTCTTTTTTAACACAAATCTTTTAACTTTAAAA
AAAGGCAAAAATTTTTTTTTTCTACTTCCCACCCAGCTTACCACCTTGATCTCTTTAACT
TATGTTCTAAACTTTGGTGTTAATGGTGGTGTCTAGCATGCTAGTAGTTAGATTTTATTT
AGATGCCATAACTGGTAATACAGCTTTTATTTTGACTATATTAATTTAGTTTTTTGAGGG
GAAGTTTGTTTATTCTGTGACTCTCAAAGCACACAGAGGTTTTAAAATATATATTATTAA
GACTGAGAGAAGAGGAAATGGGAGGGAGTAACATCACAGAAGTGCTGTTGTTCAACTGTT
CTTCAATATAGTTGCTAGTAGGTTTGTATTTACTCAGTAAGGAAGTCAGTGACCTGAACT
ACCTATAAAAATTCAGCAGTGCTGCAGTGTTGCTTAAGTGAAACCCTTTGGCTATCTAGT
AGTTTTTATGCTACTGAAACTTGGATTACTGTATGATATTCAGCTTGTCTTGGGCCCTCT
ATGTAGACAAACATTCATATTCATAGTAGTGTTGTATACTGGCCTGTTTTTATAACTTTA
TTTTTCAAATATTAACAACCACTGCTTTCAGAGTGGTTATTTTGTTATTTTTGAAGCAGG
AAATAACCATTTGTATTTGCACCTGCGTATTGCATATGAATTATGGTATACTTGGCAAAT
GCTTTTCTTTTACCTGTGAAAATTCTGAAAGCTGGTCCAAGCTACATTGCATACCAAATT
GTGCTCTTATATATTATTTGCATCGTGTCCTTTTTAATCAAATAGCATGTTTTAGTTTTA
TTATAGTAGCTTTTGCTGTAAGAATGTCACTTGCTTATCTTTTATTGTACTTGAATTCTT
AATCATGCTTTTAACATTGTATTTAACAAATCATTTCGTATTAGGTTCCATTAAAATGTC
ATTCCTTTGAAAAGGCAAGGGATTTCCACTTTCAGAATTTGAAAATGAAAGTAGCATGTT
TATCTAAAGGCAGAAAATAGTTCGGACTTGGTATTATGAAAATAAGTAATGGTTTCTGGA
GAGGATTTGTTTAGATTTGCACAGATGGCGATGGCACCTTTTACTTAAATTAACATTAAT
CAACAGTGCTAAGGAAAATTTACACAAAATTACAAGATAAAACATGGAAATGTGTGCCTT
TCAGTATACAAACTCTTGCTTGGTGGCCATTTGGGTAATCAGACCATTTGAATGCCTGAG
AGCATGTTTAATTTCTGTGGAGTGCCACATATGGCTAAAACAACTCTTTAATGTGCAATT
AATTTCTAGAGTAAAATGTCTGTTATGTGAGGGGGATCTTTATGTTGGGCTTTTCTATTT
TTTAAATGTTCACATTTCTTTCTGTTAATTAAAATGCCATCATAATGTCACATTTACACT
GTTGCCTCTTTTAAAAGCAAAGCCACTTTCTTGTTCTAAGATTACATCAAGACTTGAGCA
GTGTGTAGTAATTAAAATGTGTGCTTAATGAGCATAATAGATTCTGGTTTTAGGAAATAA
CATATAGCTTTTATATGAATATTTTCTTTTGCTATAATGAAAGTCACAGATTTTTTTTTT
CCTGGCTTTTATGGAGGAATGAAAAGAGTTGTCTCCCTCTAAGAGTATACTATTTTTGAT
TCTCATAGCAATAATGTCACCATTCTTATCAGAGGGTAAATACCCCTTGTATAGGAAAAC
AGACATAATTTCCTCTTGGGAGTTCTCTTTATGACTTAGCATTTTCTTCTACTTGAGAAA
ATTCCTGTTTTTCCGATTATTTCATCTTGAACTTTCTTTTTTTTAAGCTTTTGTGCAATG
TAATAGTTTGTTGATCCATCTTTGTACATTTTCATTTTATTTCATGTCTTTCTCTCACCT
ACCTGTCAGAATCAGCTATAGCAGATTTTGAATTCTTTAGTTAAAAAATAGTTGCTTTAC
TTGTTTCCTCATGAGTTTGTTAAATAGCTTTGCATTTTAGTCCTCTATTATGCTATGAAA
ATTATTACGAAGTTTATATTGTTCCCTTTTTAAGCCTGCCTTACTCTTGTCTTTTGTCAT
TGTCTATGGTTTAATGAAGAACACACCAAACTAACATTTTTGTTTATTTTGAGGAACAAA
AAAACTTTTCTCTTTTAAGGGAAGTTACTACACATTGAGTTAGTAACTACTCTTTCAGTC
AAGGTTCCTTAATCAGTCCAGTCTACATCAGGACTATGACTTGGGGGGCGGGGCTAATCC
TTTTTGCTGTTCTGAGCTACTATTGTCAACTGCTGTTGTACATACTGTTATGTGTAATGG
CGTAAATATATTTATTATGTTTGTAAAATTCATTGCAGATCAAGGTTGCTCTTCTGTGAT
ATATGGGATATTATGTTTTAAAGACCATCTTGGAATACAATTAGAGAACTTAGTATTTTG
ATGTACTAAGACCTATTTTAAGTTTAATATTCTACTTTGCAAAAACTTTAATTAAAGATG
TTATTTAAAAAAAAATGTTGCTTGCTTTGCTTACTAGTATATGGCATTGTTATAGATAAT
TGAATAAAATACAATTTAGAAAGGAAAATGCTTTACATTGTTAATGAGAATTCCATTTAA
CAACAACAAAAAGATGCTAAATTCTGTACCTTAAAGATAAGTAGATTGAGATGTCAATTT
GAATTAGTAAACTGTGTTACAAATGATTAATACTAGCTTTTAAAAAGTTGTATTTTCCAG
GCACACAGGAATTTAGGTTGGGCGAATTCACACTAACAAATTATAACTAAAAATTGGTAT
AATTAACATTGTTTTTCAAAATAAAGATTACTCCTTGTGAAATATTAATAATTAACATAT
TGTATTAAATAAGTATTTCTACTCCAAAGTATAGATTACTTAGGATAAAAACATTGTTAT
TTCTCTGTTTAGTCAAACCACTTCCTCTTAGTTCAGAGGTTATAAATAATTGCATATTAG
GAGAATTGGATTACTGAGGTTTGTATTGCGTATTGAATATATTTTGTGTTATTTTAGAAG
ATAATAATTAGCAGGTATTTTAATTTTATAGTTAATTCAGCTGAATCATTAAGAAGCTCG
CCTTTTTGTATTTTTTTATCCTGTTAACAGACTATCTAGAAAACATGCAAATTTTAACTA
TTAACATAATCATAATAAAGATATCTTATTTATTGCCAGCAAA

Protein Sequence

>2957 : length: 376
MANSANTNTVPKLYRSVIEDVINDVRDIFLDDGVDEQVLMELKTLWENKLMQSRAVDGFH
SEEQQLLLQVQQQHQPQQQQHHHHHHHQQAQPQQTVPQQAQTQQVLIPASQQATAPQVIV
PDSKLIQHMNASNMSAAATAATLALPAGVTPVQQILTNSGQLLQVVRAANGAQYIFQPQQ
SVVLQQQVIPQMQPGGVQAPVIQQVLAPLPGGISPQTGVIIQPQQILFTGNKTQVIPTTV
AAPTPAQAQITATGQQQPQAQPAQTQAPLVLQVDGTGDTSSEEDEDEEEDYDDDEEEDKE
KDGAEDGQVEEEPLNSEDDVSDEEGQELFDTENVVVCQYDKIHRSKNKWKFHLKDGIMNL
NGRDYIFSKAIGDAEW



')